Struktura - Instytut Muzykologii
Zakład Badań nad Muzyką Dawną
- dr hab. Jakub Kubieniec, prof. UJ – kierownik
- dr hab. Aleksandra Patalas, prof. UJ
- dr hab. Piotr Wilk, prof. UJ
- dr Marek Bebak
- dr Tomasz Górny
- dr Maciej Jochymczyk
- mgr Jolanta Bujas-Poniatowska
Zakład Badań nad Muzyką od XIX do XXI wieku
- prof. dr hab. Magdalena Dziadek – kierownik
- dr hab. Rafał Ciesielski, prof. UJ
- dr Silvia Bruni
- dr Gabriela Gacek
- dr Sylwia Jakubczyk-Ślęczka
- dr Dagmara Łopatowska-Romsvik
- dr Andrzej Sitarz
Pracownia Badań nad Multimedialnością Muzyki
- prof. dr hab. Anna G. Piotrowska – kierownik
- dr Katarzyna Babulewicz
Pracownia Badań nad Zabytkami Muzycznymi
- prof. dr hab. Renata Suchowiejko – kierownik
- dr Michał Jaczyński – kierownik
- dr Justyna Kica
- mgr Michał Jarosz
- kustosz dypl. mgr Stanisław Hrabia – kierownik
- kustosz bibl. mgr Michał Momot
- kustosz bibl. mgr Anna Salamon
- mgr Ewa Jedynak